金头闭壳龟生活于丘陵地带的山沟或水质较清澈的山区池塘内，也常见于离水不远的灌木草丛中。多昼伏夜出，白天隐藏于石块或石板下，夜间外出觅食。喜食鱼虾、蝌蚪、各种昆虫，特别是蜻蜒幼虫。饲养条件下，可食小鱼、小虾、螺肉、蝌蚪等，兼食少量植物。每年5-10月份为摄食、活动期，11月份至翌年4月份为冬眠期。金头闭壳龟胆子大且颇通人性，有时在主人喂食前后，它会爬过来同主人嬉戏或跟着主人爬行，饱餐之后频频向主人点头。

人工饲养状态下，金头闭壳龟常潜于深水区域，喜躲藏在水底石块缝隙中。当环境温度为15℃左右时，会出现停食或少食现象，10℃左右进入冬眠状态，20℃时能正常进食。每年11月至次年3月为冬眠时间，6月至8月水温超过30℃时进入半休眠状态。